המרכז הארצי הוא הכתובת היחידה של מאות בלניות ונציגי מושבים וישובים ברחבי הארץ לכל תקלה שמפריעה לפעילותם השוטפת של המקוואות.
פעמים רבות מתנערים הגופים הרשמיים מחובתם לדאוג למבנה המקווה, ו'המרכז הארצי לטהרת המשפחה' דואג לטיפול בתקלות, כולל החלפת משאבות ועוד. תיקונים אלו יכולים להגיע אף לעלות של עשרות אלפי שקלים לתיקון!
בנוסף, על מנת לייעל את תחזוקת המקוואות, פועל המרכז לסייע בהתקנת מערכות חימום חדשות של משאבות חום הפועלות באמצעות חשמל על מנת לחסוך בהוצאות הכרוכות בשימוש בתנורי סולר.
מערכות ההסקה פועלות יום יום שעות ארוכות, דבר הגורם לתקלות הנובעות מבלאי של המערכות. דבר זה משבית את פעילות המקווה ולכן המרכז פועל למתן מענה מיידי לתקלות אלו.
על מנת למנוע מצב בו ייסגר מקווה, אף ליום אחד, מחזיק המרכז הארצי צוותים זמינים של טכנאים העוסקים בתיקון המקוואות באופן סדיר והם נכונים לקריאה בכל ימות השנה, אף בערבי שבתות וחגים, כמעט בכל שעות היממה, לכל נקודת יישוב בארץ.