נשיאות המרכז בעבר:
בעבר כיהנו מנהיגי היהדות בארץ ישראל ובחו"ל כנשיאי "המרכז לטהרת המשפחה", ביניהם ניתן למנות את: מרנן האדמו"רים מגור, מבעלז ומוויז'ניץ, רבי מנחם מנדל שניאורסון מליובאוויטש, הרבי מהוסיאטין, מרן החזון איש, הגאון מטשעבין, רבי אהרן קוטלר, רבי יחזקאל אברמסקי, מרן רבי ישראל אבוחצירה - ה"בבא סאלי", מרן הגרש"ז אויערבאך, מרן הגר"ע יוסף, מרן הגראי"ל שטיינמן, מרן רבי חיים קנייבסקי, רבי גרשון אדלשטיין, רבי ברוך מרדכי אזרחי זצוק"ל, ועוד.
נשיאות המרכז בהווה:
הגאון הגדול רבי מרדכי אויערבאך שליט"א משמש כיום בתפקיד נשיא "המרכז לטהרת המשפחה" והוא ממלא את מקום אביו מאז פטירתו בשנת תשנ"ה.
חברי נשיאות העמותה כיום הינם: רבי דב לנדו, רבי שלום כהן, האדמורי"ם מבויאן, ממודזי'ץ ומזוויעהל, רבי שמעון בעדני, רבי יעקב הלל רבי ראובן אלבז שליט"א.
יו"ר המרכז:
כיום משמש הרב חיים לוי כיו"ר העמותה והוא ממשיך את פועלו הרב של אביו, הרב יהושע לוי זצ"ל, אשר שמש כמנהל העמותה למעלה מ - 60 שנה.